终于看懂：EVA 老剧场版（真心为你）与 新剧场版（Q）的关联。

　　结合新剧场版，老剧场版终于看明白了：
　　1. SEELE 想通过 Adam（亚当） 让人类进化成类似 eva 的新生命，解决人类自身进化的瓶颈。// 此前，Adam 是偶然闯入人类世界，并被人类发现和俘获的“神”。
　　2. NERV（碇源渡）想通过 Lilith（莉莉丝） 与 Adam 结合让人类融合成没有心灵隔阂的一体（精神汇入莉莉丝之卵，肉体融化成 LCL 之海）。这样的话，碇源渡 可以在莉莉丝之卵中，与自己的老婆 碇唯 再度相会。// 此前，Lilith 是另一个被发现的“神”，并一直被囚禁在 Nerv 的地底下。
　　3. 老剧场版《eva剧场版真心为你》中，SEELE 虽然手里已经没有 Adam（在 TV 版中被 加持良治 偷走并交给了 碇源渡，以胚胎形态种植在了 碇源渡 的手心），但通过“人造的神”（EVA 量产机）强行启动 人类补完计划 的进化仪式。
　　4. NERV（碇源渡）将掌心的 Adam 胚胎放入 绫波丽 的子宫，但 绫波丽 拒绝再当 碇源渡 的傀儡（其实是，不愿意抛下 碇真嗣），她带着体内 Adam 的灵魂与胚胎，飞向十字架与被囚禁的 Lilith 结合，至此，Adam 和 Lilith 结为了一体（所以巨大化后，会交替呈现出 渚薰 与 绫波丽 的模样）。
　　5. 此时 碇真嗣 需要在 Adam 和 Lilith 之间做出选择：是让人类进化成 “巨神兵”，还是融为一体的 LCL 之海？
　　6. 出于自身的心理缺陷，在 绫波丽 的帮助下，碇真嗣 选择了 Lilith 路线（所以代表 Adam 的 渚薰 的形象后来再也没出现过），全人类化为液体并融汇成一体，灵魂都集中到 莉莉丝之卵，你中有我，我中有你。
　　7. 但 碇真嗣 进入 莉莉丝之卵 后，发现彻底的 你中有我、我中有你，并不是一个他真正喜欢的世界，他还是希望生活在有他人存在的世界中，虽然人与人有隔阂，但有他人才有自己的存在感。
　　8. 于是 碇真嗣 做出了最终选择：他带着 明日香 等一部分人类恢复了肉体形态留在了地球，而另一部分人类随着 EVA（碇唯） 飞进了宇宙。所以在结尾，碇真嗣 和他母亲（碇唯）做了一次告别，一个入地，一个飞升。追随 EVA（碇唯）的人们（绿色的光芒十字架）消失在茫茫的宇宙中，并得到了永生。
　　9. 碇真嗣 回到地球后，发现旁边的 明日香 也恢复了人类的形态。这是他的第一反应还是“厌恶他人”，所以他下意识地继续掐 明日香 的脖子，但随着 明日香 伸手抚摸她的脸，他终于发现他人也有可以接受的地方，于是停手，开始哭起来，这里面既有懊悔，也有不甘，当然肯定还有更多复杂的情绪。
　　10. 明日香 的最后一句台词『你真恶心』，应该是来自存在主义哲学萨特的《恶心》，他人即地狱。
　　归根到底，这是人类自己的（不同）选择，所以在新剧场版《eva剧场版q》中，第三次冲击被称为是不完全的。