《马拉松王子》主要描述的是年轻人不畏艰险、奋勇拼搏的故事，作为以马拉松为背景的一部动画片，马拉松的文化、精神也将在动画片里很好地展现出来。另外，《马拉松王子》自然也少不了所有动画片都拥有的幽默搞怪的元素。
二十一世纪的中国，少年小飞和他的朋友们无忧无虑的生活在海滨城市的阳光下。直到一次偶然的事故改变了他的生活，一只号称是马拉松之神的毛毛虫认定少年小飞为马拉松运动的拯救者，必须完成马拉松之环的神秘任务，也只有在一次次的马拉松比赛中取得胜利，才能打败邪恶力量。将信将疑的小飞又遇到两个总在吵架的美女修罗，几个年轻人因为使命的召唤而走向了生命长跑和起跑线，命运将他们推向一次又一次惊心动魄的角逐中。在马拉松运动的竞技中，在正义与邪恶力量的对抗中，几个伙伴终于体会到了自我的价值，朋友的认同，集体的力量，也终于明白的马拉松运动的真谛。本动画片由北京华映星球国际文化发展有限公司制作，在各种历险和比赛中，真诚和执著让伙伴们勇气倍增，黑暗势力也悄然退去。
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