蓝巨星和绿豆鲨第二季走的是幽默风趣路线，剧中角色无论正面人物，还是反面人物，都有其可爱的一面。坏人免不了自作自受，正面角色却也并非总是高高在上，也会有让人忍俊不禁的小缺点。国学老师开课教茶道，珊瑚村的孩子们却嘟着嘴说“茶没有可乐好喝”。国学老师一声怒吼“排～山～倒～海～”，最后使出的却是一记太极拳。“针灸”治愈了珊瑚村厨娘的腰病，绿豆鲨认定这是一根“神针”，于是洋相百出。
珊瑚村的长者龟博士因个人原因，离开了珊瑚村，顶替他的是国学老师企鹅八古。八古号称上知天文下知地理，对古今中外无所不知无所不晓，尤其精通国学。因此，他在珊瑚村开设国学课堂，教蓝巨星等小朋友学习国学知识，练习国术。捕鱼公司老板绿豆鲨，带领招财和进宝依然驻扎在沉船谷，他们继续想方设法侵扰珊瑚村。
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