数码宝贝交错战争已于2012年3月25日播放最终回（第79话），而本作亦是数码兽系列动画的最後一部作品，这意味着数码兽合体战争播放结束後，这部系列动画将会成为历史。
某日，工藤大器听到了神秘的旋律。那是将死之人的喘息和求救声。「我…不能丢下不管！」脱口而出的太纪与发出声音的的高吼兽的心灵回响的瞬间，神秘的DEVICE·DIGIMON XROS LOADER出现了！高吼兽那行将消逝的旋律被收入其中，而太纪则被带入了未曾相识的世界。太纪战斗着，前进着。他所希望的究竟是数码世界的王者、还是和平的再临？如今在数码世界，超越想象的大战即将展开！
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