浩瀚的宇宙空间中,一颗巨大的陨石滞留在月球背面,那是[克苏鲁]的宇宙方舟。在方舟的核心部分耸立着整个方舟的中枢主脑,这艘船是有灵魂的。在那中间站立着一个穿长袍的长者,他的名字是紫罗兰,是这艘方舟的船长。他给赫巴洛特下达了进攻地球的命令,并且派出妖怪军团去追杀阻碍他们的那个女孩——伊库莎One 伊库莎One一边不断与[克苏鲁]的怪物们战斗,一边寻找到了她的另一半——名叫加奈渚砂(另译佳奈渚)的人类女孩...
少女加奈渚砂原本是一名普通的高中生。有着平凡而幸福的家庭。但是[克苏鲁]派来的妖怪却让她的人生完全改变。仿佛噩梦般地开始,同学和家人竟然在她面前变成了妖怪,进入身体的妖怪的触手散发着恐慌和绝望的气息...在千钧一发之际,伊库莎One将她救出困境,但是残酷的现实让渚砂陷入了恐慌,而拒绝向伊库莎One伸出援手。加奈渚砂能否肩负起自己的使命?地球会不会就此毁灭?在宇宙中流浪的[克苏鲁]又是何方神圣?所有的谜团将被解开……
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